L’ADN humain peut maintenant être extrait de rien et séquencé

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Empreintes laissées sur une plage. L’air respiré dans une pièce animée. L’eau de l’océan.

Les scientifiques ont pu collecter et analyser des données génétiques détaillées à partir de l’ADN humain de tous ces endroits, soulevant des questions éthiques épineuses sur le consentement, la confidentialité et la sécurité en ce qui concerne nos informations biologiques.

Les chercheurs de l’Université de Floride, qui utilisaient l’ADN environnemental trouvé dans le sable pour étudier les tortues marines en voie de disparition, ont déclaré que l’ADN était d’une telle qualité que les scientifiques pouvaient identifier les mutations associées à la maladie et déterminer l’ascendance génétique des populations vivant à proximité.

Ils pourraient également faire correspondre des informations génétiques à des participants individuels qui s’étaient portés volontaires pour récupérer leur ADN dans le cadre de la recherche publiée lundi dans la revue scientifique Nature Ecology & Evolution.

“Toutes ces données très personnelles, ancestrales et liées à la santé sont librement disponibles dans l’environnement et flottent simplement dans l’air en ce moment”, a déclaré David Duffy, professeur de génomique des maladies de la faune à l’Université de Floride.

L’ADN environnemental a été obtenu à partir de l’air, du sol, des sédiments, de l’eau, du pergélisol, de la neige et des carottes de glace et les techniques sont principalement utilisées pour aider à suivre et à protéger les animaux en voie de disparition.

L’ADN humain qui s’est infiltré dans l’environnement par notre salive, notre peau, notre sueur et notre sang pourrait être utilisé pour aider à retrouver des personnes disparues, aider à des enquêtes médico-légales pour résoudre des crimes, localiser des sites d’importance archéologique et pour la surveillance de la santé grâce à l’ADN trouvé dans les eaux usées. , note l’étude.

Cependant, la capacité de capturer l’ADN humain de l’environnement pourrait avoir une série de conséquences imprévues – à la fois involontaires et malveillantes, ont-ils ajouté. Il s’agissait notamment d’atteintes à la vie privée, de localisation, de collecte de données et de surveillance génétique d’individus ou de groupes. Cela pourrait entraîner des obstacles éthiques à l’approbation des études sur la faune.

Matthias Wienroth, chercheur principal étudiant les aspects sociaux et éthiques de la génétique en criminalistique, surveillance et santé humaine à l’Université de Northumbria au Royaume-Uni, a déclaré que les scientifiques impliqués dans l’étude avaient pris au sérieux les “aspects éthiques de leur travail” et “identifié certaines questions clés qui sont susceptibles d’émerger avec leurs conclusions.

« Il est important de préserver l’autonomie humaine, la dignité et le droit à l’autodétermination sur les données personnelles. C’est difficile si vous ne pouvez pas demander l’autorisation à ceux dont l’ADN peut être collecté dans l’environnement, car il n’y a probablement aucun moyen d’éviter de perdre de l’ADN dans l’environnement via la peau, les cheveux et la respiration”, a déclaré Wienroth, qui n’était pas impliqué dans la recherche, a déclaré par e-mail.

Il a souligné la nécessité de développer et de déployer la prévoyance dans la recherche en génétique et en génomique : « Un problème clé est que de telles découvertes accidentelles d’ADNe peuvent se retrouver dans des bases de données qui peuvent être comparées aux données des utilisateurs dans d’autres bases de données génétiques, compromettant ainsi le consentement éclairé et même le client. confidentialité.”

L’équipe du Whitney Laboratory for Marine Bioscience and Sea Turtle Hospital de l’Université de Floride utilisait de l’ADN environnemental – récupéré à partir de traces de tortues faites sur du sable – pour étudier les tortues vertes en voie de disparition et les cancers viraux auxquels elles sont sensibles, lorsqu’elles ont remarqué qu’elles étaient captant également l’ADN humain du sable et dans l’océan et les rivières entourant le laboratoire.

Ils ont qualifié cette information de “prise accessoire génétique humaine” et ont décidé d’étudier le phénomène plus en profondeur.

En plus des échantillons de la Floride subtropicale, Duffy a testé l’eau de la rivière Avoca dans le comté de Wicklow en Irlande tempérée, trouvant de l’ADN humain alors qu’il traversait la ville d’Arklow – mais pas dans les cours supérieurs de la rivière où il n’y avait aucune habitation humaine.

Ils ont également récupéré l’ADN d’empreintes faites dans le sable par quatre volontaires. Avec leur permission, ils ont pu séquencer une partie des génomes des participants. Ensuite, les chercheurs ont prélevé des échantillons d’air dans une pièce de 280 pieds carrés d’une clinique vétérinaire où six personnes travaillaient pendant qu’elles accomplissaient leurs tâches habituelles. routine quotidienne. L’équipe a récupéré l’ADN qui correspondait aux volontaires du personnel, aux patients animaux et aux virus animaux courants.

À partir des informations génétiques recueillies par les scientifiques, ils ont pu identifier des variantes génétiques associées aux populations européennes et latino-américaines et des variations associées à une gamme de troubles et de maladies telles que l’autisme, le diabète, les maladies oculaires, le cancer et les maladies cardiaques.

“Ces séquences ont récupéré à la fois les régions nucléaires et mitochondriales du génome humain, ce qui signifie que nous pouvons facilement déterminer si un homme ou une femme (marchait) au soleil ou (leur) présence dans une pièce selon que nous avons ou non séquencé le Chromosome X ou Y », a expliqué Duffy lors d’une conférence de presse.

“En utilisant le génome mitochondrial, nous avons pu étudier l’ascendance génétique de nos échantillons.”

Yves Moreau, professeur à l’Université de Louvain en Belgique, qui étudie l’intelligence artificielle et la génétique et a mis en lumière les prélèvements d’ADN en Chine sur les minorités tibétaines et ouïghoures, a déclaré que s’il était possible d’imaginer un scénario où “une mafia ou une dictature suivre un témoin protégé ou un réfugié politique » en utilisant le séquençage des eaux usées, cela restait « un peu tiré par les cheveux ».

« Nous avons besoin d’une discussion politique sur les attentes en matière de vie privée dans l’espace public, en particulier pour l’ADN. Nous ne pouvons pas éviter de répandre de l’ADN dans l’espace public », a déclaré Moreau, qui n’a pas participé à cette étude, par e-mail.

« Il ne faut cependant pas paniquer, et j’ai toujours peur des précautions qui immobiliseraient la recherche. C’est un équilibre délicat à trouver. »